Open OnDemand/fr

Introduction¶

Nous décrivons ici les étapes de base pour démarrer avec Open OnDemand (OOD) sur nos systèmes.

Open OnDemand est une plateforme web qui donne accès à un large éventail d'applications scientifiques et de ressources de calcul telles que Jupyter Lab, RStudio et VS Code. Elle vous permet d'interagir avec une de nos grappes via un navigateur web, sans avoir à installer de logiciel sur votre ordinateur local. Vous pourrez gérer des fichiers, soumettre et suivre des tâches, et exécuter des applications de manière interactive. Pour plus d'information sur ce projet, voir openondemand.org. Pour la documentation spécifique à chacune des grappes, voir :

Se connecter au portail Open OnDemand¶

Pour accéder au portail Open OnDemand, ouvrez un navigateur web et sélectionnez l'instance OnDemand, par exemple : Trillium, Vulcan ou Nibi. Saisissez votre nom d'utilisateur et votre mot de passe de l'Alliance, puis effectuez l'authentification multifacteur via Duo ou Yubikey. Une fois connecté, le tableau de bord Open OnDemand s'affichera. Vous pourrez alors accéder aux différents outils et applications disponibles.

Gestion des fichiers¶

Un navigateur de fichiers permet de parcourir vos fichiers et répertoires du système de fichiers. Pour y accéder, cliquez sur l'onglet Fichiers et sélectionnez le répertoire dans le menu déroulant (HOME, SCRATCH ou PROJECT). Avec l'interface, vous pouvez :

Naviguer dans vos répertoires
Téléverser et télécharger des fichiers
Créer des fichiers et des répertoires
Supprimer des fichiers et des répertoires
Modifier des fichiers existants

Téléverser des fichiers¶

La taille maximale des fichiers à téléverser est présentement de 10 Go. Pour téléverser un fichier plus volumineux ou si vous rencontrez des problèmes de téléversement (par exemple, en raison d'une mauvaise connexion Internet), utilisez Globus Globus. L'interface web de Globus vous permet de vous connecter avec votre nom d'utilisateur et votre mot de passe de l'Alliance. Le chemin d'accès affiché dans le navigateur Open OnDemand sera identique à celui ouvert dans Globus.

Soumettre une tâche¶

Open OnDemand offre une interface pour soumettre des tâches en lots. Sous l'onglet Tâches, sélectionnez Composition de tâches pour accéder au formulaire de soumission. Cliquez ensuite sur le bouton Nouvelle tâche pour faire afficher les options suivantes :

À partir d'un modèle par défaut, pour créer une nouvelle tâche;
À partir d'un modèle, pour sélectionner une tâche, par exemple MPI et OpenMP;
À partir d'un chemin spécifié, pour utiliser une tâche dans le système de fichiers;
À partir de la tâche sélectionnée, pour copier la tâche active.

Vous pouvez spécifier les paramètres de la tâche, tels que le script et le nom du compte, en utilisant le bouton Options de tâche. Les autres paramètres, comme le nombre de nœuds, le nombre de cœurs, le temps d'exécution, etc., peuvent être modifiés directement dans le script en cliquant sur le bouton Ouvrir l'éditeur. Une fois les champs obligatoires remplis, cliquez sur le bouton Soumettre.

Cette page affiche également l'état de votre tâche : en attente, en cours d'exécution ou terminée. Une fois la tâche terminée, vous pouvez consulter les journaux de sortie et d'erreurs en cliquant sur un fichier dans la section Contenu du dossier du panneau de droite Détails de la tâche.

Suivi des tâches¶

Pour obtenir une vue d'ensemble de toutes vos tâches en attente, utilisez l'interface de suivi des tâches. Sous l'onglet Tâches, sélectionnez Tâches actives. Vous pouvez utiliser le champ Filtrer en haut à droite. Vous pouvez trier les colonnes en cliquant sur leur en-tête, par exemple par état (en cours, terminée, échouée, etc.). Cliquer sur le symbole > à gauche d'une tâche affiche des informations supplémentaires, telles que l'heure de début et de fin, la liste des nœuds et le compte facturé. Pour afficher toutes les tâches, cliquez sur le menu déroulant en haut à droite et sélectionnez Toutes les tâches.

Applications interactives¶

Open OnDemand offre aussi des applications interactives exécutables directement depuis votre navigateur web. Sous l'onglet Applications interactives, sélectionnez l'application voulue dans le menu déroulant. Ceci affiche la page de soumission des tâches, où vous pouvez choisir les paramètres de votre tâche, par exemple :

Durée de la tâche (en heures)
Nombre de cœurs
Quantité de mémoire à allouer (en Go)
Notification par courriel du début de la tâche

Après avoir sélectionné les paramètres de votre tâche, cliquez sur le bouton Lancer pour l'ajouter à la file d'attente. La page Mes sessions interactives s'affichera, où vous pouvez consulter l'état de votre tâche (en file d'attente, en cours d'exécution ou terminée). Une fois la tâche affectée à un nœud et en cours d'exécution, cliquez sur le bouton Connecter à... pour lancer l'application. Celle-ci s'ouvre dans un nouvel onglet où vous pouvez travailler avec la tâche comme si elle était exécutée localement.

Pour accéder au terminal du nœud sur lequel l'application s'exécute, par exemple pour en surveiller les performances, cliquez sur le bouton situé à côté de l'Hôte commençant par >_. Une fenêtre de terminal s'ouvrira alors dans votre navigateur où vous pouvez exécuter directement des commandes sur le nœud.

Si vous souhaitez mettre fin à la tâche pour une quelconque raison, vous pouvez le faire en cliquant sur le bouton rouge Annuler dans le panneau de la tâche, sur la page Mes sessions interactives.

Accès via terminal¶

Si vous préférez utiliser un terminal pour interagir avec la grappe, Open OnDemand met à votre disposition un terminal web pour accéder à l'interface ligne de commande. Pour ce faire, rendez-vous dans l'onglet Grappes et sélectionnez Accès Shell Nom_de_la_grappe. Une nouvelle fenêtre de terminal s'ouvrira alors dans votre navigateur, où vous pouvez exécuter des commandes comme dans une application de terminal.

Débogage¶

Si des erreurs surviennent lors de l'utilisation d'une tâche interactive Open OnDemand, vous pouvez consulter les journaux pour obtenir plus d'information. Dans l'onglet Mes sessions interactives, sélectionnez votre session active. Cliquez sur le lien output.log pour ouvrir un nouvel onglet affichant la sortie de votre tâche. Ce fichier contient la sortie standard et les messages d'erreur générés par la tâche, ce qui peut vous aider à identifier les problèmes survenus pendant la session. Lorsque vous soumettez une demande d'assistance au soutien technique de SciNet, veuillez inclure le fichier output.log, l'identifiant de la session (une longue chaîne de caractères semblable à 8feb45fa-bc65-4846-8398-2a73c1bf8e5a) et toute autre information pertinente afin de nous permettre de vous aider plus efficacement.