Galaxy/fr

Introduction¶

Galaxy est une plateforme web open source pour la recherche biomédicale traitant de grandes quantités de données. La plateforme rend la biologie computationnelle plus accessible, sans exiger une grande expérience en programmation ou en administration de systèmes. Conçue au départ pour la recherche en génomique, Galaxy s’adapte aujourd'hui à la plupart des domaines et sert de système de gestion du flux de travail en bio-informatique. Cette liste de tutoriels présente une bonne vue d’ensemble des possibilités qu’offre Galaxy.

Recommandation

La plateforme UseGalaxy est fortement recommandée pour le traitement de gros fichiers ou pour des tâches qui nécessitent plusieurs unités centrales de traitement (CPU) ou unités de traitement graphique (GPU).

Accéder à UseGalaxy Canada¶

Pour accéder à UseGalaxy Canada, simplement suivre le lien https://starthere.usegalaxy.ca, puis cliquer sur le bouton de connexion via CILogon et sélectionner votre établissement pour vous authentifier. La plateforme détecte si vous êtes un utilisateur canadien et vous octroie automatiquement une allocation par défaut de 500 Go de stockage.

Caractéristiques techniques¶

Serveurs : nuages Béluga et Arbutus
Configuration de Galaxy : aucune (responsabilité de UseGalaxy Canada)
Connaissance de Linux : aucune
Gestion et mises à jour : aucune (responsabilité de UseGalaxy Canada)
Configuration du serveur : aucune
Outils préinstallés : synchronisés avec UseGalaxy.eu
Disponibilité de génomes de référence : via CVFMS
Quota : 500 Go par utilisateur

Le site https://starthere.usegalaxy.ca fournit toute l’information nécessaire concernant UseGalaxy.ca et Galaxy en général, de même qu’un formulaire si vous avez besoin d’assistance, voulez rapporter un problème, ou encore faire installer de nouveaux outils ou bases de données.